仪器简介：

Ion PGM™ 测序仪拥有目前最快的新一代测序流程，从构建文库到数据分析，不到8小时。就测序运行本身来说，对于100 bp读取，全新的Ion 316™芯片需要2小时运行时间，与Ion 314™芯片相同。在测序短读取时，运行时间缩短至1小时内。单日流程加快了研究周期和文章发表，可实现更多的研究和市场应用。

仪器用途：

全基因组测序；体细胞突变测序；用于体细胞和生殖细胞系测序的定制基因集合；De Novo测序；小RNA和基因表达研究；ChIP测序；农业应用测序。

仪器特点 ：

1.  New Personal Genome Machine (PGM™) System带来了所有新一代测序仪中最快的运行时间，实现了单日流程；

2. 支持三种不同价格和通量的半导体芯片，可应对各种灵活的、扩展的项目产生准确的长读取，适合广泛的DNA和RNA测序应用。

仪器信息：

仪器型号：Ion PGM

生产产家：lifetechnologies

仪器价格：46.13万元

购置日期：2013.10

小型基因测序仪Ion PGM型 操作规程

一、检查气源

1.测序前确保Server处于打开状态、检查高纯氮气瓶气压（如低于500psi 需及时更换气瓶）、确保网页浏览器能登录上server。

2.打开氮气瓶，将输出气压调至30psi；打开Ion Proton电源。

二、Ion Proton 仪器清洗： 

1.氯片清洗：配制氯液，点击Clean,  按提示选择氯洗，将两个氯洗管（各100ml）装在C1和C2位置，进行氯洗, 结束后按next 回到主界面。

2.按氯洗的方法进行18MΩ去离子水清洗。

三、Ion Proton 初始化： 

1.用18MΩ水润洗W2试剂瓶和W1、W3试剂管，分别配制好W1、W2和W3试剂；

2.点击Initialize, 按照屏幕提示选择试剂盒类型，更换新的sippers,将W1、W2和W3试剂装在W1、W2和W3 位置，进行第一阶段初始化；

3.准备dGTP, dCTP, dATP和dTTP, 待第一阶段初始化结束，更换新的sippers,将装有dNTP的试剂管装在对应的位置，拧紧，进行最后初始化，结束后点Next,回主页面。

四、设置测序plan：

1.在网页浏览器地址栏输入server IP, 进入Torrent browser；

2.点击plan 进行设置：填写run name,选择正确的library kit, Templating kit, sequencing kit, Flows, Chip types, barcode及对应样本名称等。

五、Loading 芯片和上机测序：

1.点击PGM主界面RUN,按屏幕提示对新的芯片进行Chip check, 结束后显示passed，将芯片取出进行loading；

2.Loading 芯片： ISP经引物和测序酶预结合后，使用芯片离心机进行芯片loading；

3.将loading好的芯片放在PGM基座上，选择设置好的plan后进行测序。测序时间2-8hr，根据不同芯片类型及Flow数的不同。

六、测序结束：

1.可登录torrent browser ，查看测序报告或下载数据文件；

2.对PGM进行18MΩ去离子水清洗和关机：关机步骤（tools-shutdown），注意关机前，确保数据已传输完成（即测序报告已出）。

3.关闭氮气瓶。

注意事项：

未经培训一律不得上机操作，如需使用请联系平台工作人员。